La SCANORMANDE est administrée par un conseil d’administration composé d’adhérentes et d’adhérents E.Leclerc, membres de la SCANORMANDE. La présidence est assurée par une adhérente ou un adhérent élu·e par ses pairs.
Le conseil d’administration entretient une relation fonctionnelle directe avec la direction générale de la SCANORMANDE. Celle-ci supervise l’ensemble des services, en coordination avec plusieurs directrices et directeurs, ainsi qu’une assistante ou un assistant de direction. Les différents services sont la logistique, les ressources humaines, la gestion des flux de marchandises, le développement commercial, les systèmes d’information, les aspects techniques, ainsi que les fonctions administratives et financières.